二、各业务科室的职责权限
综合科
负责对外接待、业务协调、咨询、人民来信来访等工作。
对外宣传办公室通关科
负责办理陆路进出口货物的通关手续；负责办理普陀区区属企业进口货物的通关手续；负责办理铁海联运中转及转关运输货物的海关手续。
监管科（普陀监管站）
负责办理普陀、闸北两区外商投资企业及区属中资工外贸企业的加工贸易合同备案、中期核查、后期核销；负责办理普陀区外商投资企业的减免税货物审批。
旅检科
负责本关区沪港列车及其服务人员携带物品、旅客行李物品的监管；接受进出境人员的申报,按规定验核其所携行李物品,并办理征、免、扣、退等有关手续；查缉非贸渠道走私违规案件、印刷品和音像制品。
调查科
负责辖区内进出口货物、加工贸易企业和特定减免税进口设备的稽查工作；负责辖区内企业注册、变更、注销、异地备案、企业IC卡申请；负责辖区内企业的海关减免税设备后续管理（闸北区三资企业除外）；负责辖区内企业年审；负责逾期未报货物、物品和企业、进出境旅客放弃物品的处理工作；负责辖区内稽查查获案件的结处、移交等工作。