二、各业务科的职责权限
加工贸易备案科
负责办理除卢湾监管科、杨浦监管科、长宁监管科、徐汇监管科监管范围企业的加工贸易合同备案审批工作；负责异地企业在沪加工的加工贸易合同备案审批工作；负责上述所辖企业的深加工结转审批工作；负责职权范围内遗失手册的补发工作；负责开展对承接加工贸易业务企业的验厂工作。
加工贸易核销科主要职责
负责办理除卢湾监管科、杨浦监管科、长宁监管科、徐汇监管科监管范围外企业的加工贸易合同中期核查和后续核销管理工作；负责异地企业在沪加工的加工贸易合同中期核查和后续核销管理工作；负责对本科业务范围内加工贸易项下进口料件的单耗收集、汇总、分析工作；负责除卢湾监管科、杨浦监管科、长宁监管科、徐汇监管科监管范围外所辖保税集团、保税工厂的监管工作，负责受理、上报监管辖区内设立保税集团、保税工厂的申请；负责除卢湾监管科、杨浦监管科、长宁监管科、徐汇监管科监管范围外本处其他所辖企业加工贸易到期合同的催报和报核工作；负责除卢湾监管科、杨浦监管科、长宁监管科、徐汇监管科监管范围外所辖企业的分类管理适用类别审评工作。
保税业务通关科
负责办理所辖保税仓库货物的通关手续；、负责办理除卢湾监管科、杨浦监管科、长宁监管科、徐汇监管科监管范围外的加工贸易货物后续监管补税、减免税货物后续监管补税（含调查局稽查处）、稽查补税、调查违规案件补税等手续；、负责办理上述通关、补税手续中的进口货物书面单证审核和各类有效证件的核注，对货物的价格、税则归类等项目进行复核，办理税费征收、核销、欠税催交手续，根据审核结果或布控指令进行查验或取样送检后作放行处理；负责受理保证金、保证函申请及保证金转退和退税申请，办理保证金、保证函的销保手续，征收滞报金、滞纳金；负责进出口报关单证明联的后置签发工作；、负责对区域海关监管范围外的各类保税仓库的监管工作；负责受理、上报该区域内设立、变更保税仓库的申请；负责除杨浦监管科、长宁监管科、徐汇监管科外的加工贸易合同档案、报关单档案、企业注册登记档案、年审档案、减免税管理档案等档案管理工作。
卢湾监管科
负责办理卢湾区内海关注册企业的通关手续，包括进口货物书面单证审核和各类有效证件的核注，对货物的价格、税则归类等项目进行复核，办理税费、滞报金、滞纳金的征收、核销手续，根据审核结果或审单中心的布控、化验指令制做关封由口岸海关实施查验或取样送检；负责受理业务范围内的保证金、保证函申请，办理保证金、保证函的退、转、销保手续，受理企业退税申请、办理退税手续；负责税费催缴工作；负责进出口报关单证明联的后置签发工作；负责办理卢湾区、静安区、黄浦区内企业（市属和区属的三资企业、区属的工、外贸公司）和本处辖区内的市属工、外贸公司的注册登记、日常管理，负责办理本科辖区内(卢湾区、静安区、黄浦区)区属企业的年审工作，配合处里做好本科辖区内市属企业和本处辖区内市属工、外贸公司的年审工作；负责办理卢湾区、静安区、黄浦区内海关注册企业（市属和区属的三资企业）减免税登记、进口货物的减免税审批和办结海关手续等工作，负责对卢湾区内减免税货物的后续管理和稽查工作；负责办理卢湾区内海关注册企业（市属和区属三资企业、区属工、外贸公司）（下同）的加工贸易合同审批、验厂、中期核查和后续核销管理工作；负责办理卢湾区内海关注册企业的保税料件深加工结转审批工作；负责对卢湾区内加工贸易项下进口料件的单耗收集、汇总、分析工作；负责对卢湾区内企业加工贸易到期合同的催报和报核工作；负责对卢湾区、静安区、黄浦区内无进出口经营权的加工贸易加工企业资格的审核工作；负责卢湾区内企业涉嫌走私、违规案件的查办工作；负责开展对卢湾区内企业的常规稽查、专项稽查工作；负责监管辖区内企业的分类管理适用类别审评工作。
杨浦监管科
负责办理杨浦区、虹口区内海关注册企业的通关手续，包括进口货物书面单证审核和各类有效证件的核注，对货物的价格、税则归类等项目进行复核，办理税费、滞报金、滞纳金的征收、核销手续，根据审核结果或审单中心的布控、化验指令制做关封由口岸海关实施查验或取样送检；负责受理业务范围内的保证金、保证函申请，办理保证金、保证函的退、转、销保手续，受理企业退税申请、办理退税手续，负责税费催缴工作；负责进出口报关单证明联的后置签发工作；负责办理杨浦区、虹口区内企业（市属和区属三资企业、区属工、外贸公司）（下同）的注册登记、日常管理，负责办理本科辖区内区属企业的年审工作，配合处里做好本科辖区内市属企业的年审工作；负责办理杨浦区、虹口区内海关注册企业（市属和区属三资企业）减免税登记、进口货物的减免税审批、减免税货物后续监管和办结海关手续等工作；负责办理杨浦区、虹口区内海关注册企业的加工贸易合同审批、验厂、中期核查和后续核销管理工作；负责办理杨浦区、虹口区内海关注册企业的保税料件深加工结转审批工作；负责对监管辖区内加工贸易项下进口料件的单耗收集、汇总、分析工作；负责对监管辖区内企业加工贸易到期合同的催报和报核工作；负责对杨浦区、虹口区内无进出口经营权的加工贸易加工企业资格的审核工作；负责对监管辖区内保税仓库的日常监管工作；负责监管辖区内企业涉嫌走私、违规案件的查办工作。
长宁监管科
负责办理长宁区内海关注册企业的通关手续，包括进口货物书面单证审核和各类有效证件的核注，对货物的价格、税则归类等项目进行复核，办理税费滞报金、滞纳金的征收、核销手续，根据审核结果或审单中心的布控、化验指令制做关封由口岸海关实施查验或取样送检，特殊情况可以经口岸海关同意后自行进行查验或取样送检；负责受理业务范围内的保证金、保证函申请，办理保证金、保证函的退、转、销保手续，受理企业退税申请、办理退税手续，负责税费催缴工作；负责进出口报关单证明联的后置签发工作；负责办理长宁区内企业（市属和区属三资企业、区属的工、外贸公司）（下同）的注册登记、日常管理，负责办理本科辖区内区属企业的年审工作，配合处里做好本科辖区内市属企业的年审工作；负责办理长宁区内海关注册企业（市属和区属三资企业）减免税登记、进口货物的减免税审批、减免税货物后续监管和办结海关手续等工作；负责办理长宁区内海关注册企业的加工贸易合同审批、验厂、中期核查和后续核销管理工作；负责办理长宁区内海关注册企业的保税料件深加工结转审批工作；负责对监管辖区内加工贸易项下进口料件的单耗收集、汇总、分析工作；负责对监管辖区内企业加工贸易到期合同的催报和报核工作；负责对长宁区内无进出口经营权的加工贸易加工企业资格的审核工作；负责对监管辖区内保税仓库的日常监管工作；负责监管辖区内企业涉嫌走私、违规案件的查办工作；、负责开展对监管辖区内企业的常规稽查、专项稽查工作；负责监管辖区内企业的分类管理适用类别审评工作。
徐汇监管科
负责办理徐汇区内海关注册企业的通关手续，包括进口货物书面单证审核和各类有效证件的核注，对货物的价格、税则归类等项目进行复核，办理税费、滞报金、滞纳金的征收、核销手续，根据审核结果或审单中心的布控、化验指令制作关封由口岸海关实施查验或取样送检；负责受理业务范围内的保证金、保证函申请，办理保证金、保证函的退、转、销保手续，受理企业退税申请、办理退税手续，负责税费催缴工作；负责进出口报关单证明联的后置签发工作；负责办理徐汇区内企业（市属和区属三资企业、区属的工、外贸公司）（下同）的注册登记、日常管理，负责办理本科辖区内区属企业的年审工作，配合处里做好本科辖区内市属企业的年审工作；负责办理徐汇区内海关注册企业（市属和区属三资企业）减免税登记、进口货物的减免税审批、减免税货物后续监管和办结海关手续等工作；负责办理徐汇区内海关注册企业的加工贸易合同审批、验厂、中期核查和后续核销管理工作；负责办理徐汇区内海关注册企业的保税料件深加工结转审批工作；负责对监管辖区内加工贸易项下进口料件的单耗收集、汇总、分析工作；负责对监管辖区内企业加工贸易到期合同的催报和报核工作；负责对徐汇区内无进出口经营权的加工贸易加工企业资格的审核工作；负责监管辖区内企业涉嫌走私、违规案件的查办工作；负责开展对监管辖区内企业的常规稽查、专项稽查工作；负责监管辖区内企业的分类管理适用类别审评工作。